知网查重不按章节查是因为知网查重系统采用的是整体性检测模式，即将整篇文档作为一个整体进行查重，而不是按章节分别查重。这种方式可以更全面地检测文档的原创性，避免了局部抄袭的可能性。此外，整体性检测还能更好地保护文档的完整性，确保文档的原意不被分割或篡改。

另外，知网查重不按章节查还可以提高查重的效率，节约时间成本。如果按章节查重，系统需要逐章逐节地比对文档，耗时较长且容易遗漏重复部分。而整体性检测模式可以一次性完成查重过程，快速准确地判断文档的原创性，提高了工作效率。因此，知网查重不按章节查是出于综合考虑效率、准确性和原文完整性的目的。